IUDN kria no funsiona bazeia ba konjuntu instrumentu legál sira ne’ebé define ninia estrutura, autonomia, no regra operasionál sira. Entre instrumentu enkuadramentu prinsipál sira, tuirmai ne’e destaka:
1. Kriasaun Dekretu-Lei, ne’ebé estabelese Institutu, nia natureza, no nia objetivu sira.
2. Estatutu provizóriu sira, ne’ebé organiza funsionamentu internu, kompeténsia sira, rekursu sira, no atividade ensinu no peskiza nian.
3. Rejime administrasaun indireta Estadu nian, aplikavel ba entidade sira ho natureza ida-ne’e, tuir termu sira Dekretu-Lei No. 30/2020, loron 29 fulan-jullu nian.
4. Lejislasaun ensinu superiór nian, liuliu kona-ba asuntu sira kona-ba avaliasaun, akreditasaun, no rekoñesimentu ba diploma no grau akadémiku sira.
5. Regulamentu kona-ba finansa públika, ne ebé enkuadra finansiamentu no jestaun orsamentál, hodi garante autonomia finanseira no patrimoniál tuir termu legál.
6. Regulamentu internu, ne’ebé detallu kona-ba modelu jestaun, organizasaun serbisu, no funsionamentu sistema ensinu no peskiza.
Enkuadramentu ida-ne’e garante IUDN nia autonomia administrativa, finanseira, akadémika, no sientífika, konsistente ho Timor-Leste nia polítika públika kona-ba defeza no ensinu superiór.